机电工程学院成立于1996年，学院前身为机械工程系，由中国人民解放军军事工程学院（哈军工）舰炮专业发展而来。学院下设：智能制造工程系、机械电子工程系、机械设计及自动化系、工业设计系等教学科研机构。

学院现有“机械设计制造及其自动化”、“智能制造工程”、“工业设计”、“机械设计制造及其自动化（中外联合办学）”4个招生本科专业；具有“机械工程”、“设计学”2个一级学科硕士学位授权点，“机械”硕士专业学位授权点；具有“机械工程”一级学科博士学位授权点（包含“机械设计及理论”、“机械电子工程”、“机械制造及其自动化”、“车辆工程”4个二级学科），“机械”博士专业学位授权点；拥有“机械工程”博士后科研流动站。其中，“机械设计制造及其自动化”专业为国家一流建设专业、黑龙江省一流建设专业、黑龙江省重点专业并通过工程教育认证，“工业设计”专业为国家一流建设专业、黑龙江省、工业和信息化部重点本科专业，“机械工程”一级学科为“十三五”国家国防特色学科、黑龙江省首批重点一级学科。

学院师资力量雄厚，梯队结构合理。现有教职工124人，其中，专任教师95人，教授29人，副教授41人，博士生导师29人；入选国家级青年人才项目、享受国务院特贴、国防科技“511人才工程”、教育部教指委委员等国家、省部级人才20余人。

学院是国内较早从事水下装备研究的主要单位之一,主持或参与了水下作业装备等多项项目，近年在机械强度与设计、水下作业技术、特种机器人技术、现代集成制造技术研究中取得了丰硕成果，在机械、电子、自动控制等领域也取得了显著成绩，具有承担机械工程领域重大应用基础研究、新概念和新技术创新、关键技术攻关等能力。近五年，承担科研项目180余项，其中国家重大科技专项、国家科技支撑项目、国家自然科学基金重点项目等纵向项目60余项；科研经费超过1.7亿元；获国家级科技进步二等奖1项，省部级科技奖16项，发表论文800余篇，其中SCI276篇、EI检索526篇；发明专利申请501项、授权430项，出版专著和教材28部。

学院具有配套的实验设备和先进的测试手段，具有省部级重点实验室3个和省部级工程中心1个，有25个专业实验室，实验室总面积约2150余平方米。其中，舰船特辅与水下装备重点实验室是工信部重点实验室，CIMS研究中心是黑龙江省现代制造工程技术研究中心、水下作业技术与装备实验室为黑龙江省重点实验室、机械工程实验教学中心为黑龙江省实验教学示范中心。

学院现有在校本科生1195人，硕士研究生638人，博士研究生162人，在站博士后研究人员10人，外国留学生31人。学院非常重视大学生科技创新活动，投入建设大学生科技创新基地，全面促进大学生科技创新与实践能力的培养。近年来，学院获得中国青少年科技创新奖3人次，“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛奖12项，亚太大学生机器人电视大赛亚太季军1次、全国亚军1次、季军1次，全国机械创新设计大赛奖13项，第53届加拿大魁北克国际雪雕比赛二等奖，意大利布利克里奇国际雪雕大赛二等奖，首届全国大学生工业设计大赛“中国工业设计奖”终评概念作品等国家级以上奖项185项、专利30余项。学院本科生参加科技创新活动比例连续多年达100%，其出色的创新精神与实践能力深受用人单位好评。